肛肠科始建于1991年，为自贡市重点中医肛肠专科，是县域内唯一独立设置病区的肛肠专科，目前开放床位60张。现有医护人员13名，其中高级职称3名，中级职称4名，初级职称5名，助理医师1名，自贡市优秀医学专家1名，自贡市中医肛肠专业医疗质量控制中心市级专家2名。
科室坚持中西医结合治疗，突出中医特色，采用中药内服、外敷、肛塞、熏洗、坐浴、穴位贴敷及手术等多种治疗手段配合，治疗痔疮、肛裂、肛瘘、肛周脓肿、肛乳头瘤、直肠息肉、直肠脱垂、直肠前突、直肠阴道瘘、先天性肛门畸形、肛门直肠狭窄、肛门失禁、结直肠炎、顽固性便秘、肛门瘙痒、肛门直肠尖锐湿疣等肛肠疾病。根据病情合理设计手术方式，多重技术联合运用，注重提高远期疗效及保护肛门功能。现已成为本地及辐射周边区域颇具影响力的肛肠专科，科室同时承担实习学生、转科医师、进修人员的带教工作。
